MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium sp. JLS chromosome

Total Repeats: 164585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009077	CGG	2	6	18581	18586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432629
502	NC_009077	CG	3	6	18603	18608	0 %	0 %	50 %	50 %	126432629
503	NC_009077	GGT	2	6	18776	18781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126432629
504	NC_009077	GTGC	2	8	18796	18803	0 %	25 %	50 %	25 %	126432629
505	NC_009077	CGA	2	6	18821	18826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432629
506	NC_009077	ACG	2	6	18873	18878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432629
507	NC_009077	CTG	2	6	18886	18891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432629
508	NC_009077	CCG	2	6	18919	18924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432629
509	NC_009077	CTCGC	2	10	18989	18998	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
510	NC_009077	GCG	3	9	19037	19045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432630
511	NC_009077	TGG	2	6	19047	19052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126432630
512	NC_009077	CGGCG	2	10	19063	19072	0 %	0 %	60 %	40 %	126432630
513	NC_009077	GCC	2	6	19102	19107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432630
514	NC_009077	GGTC	2	8	19194	19201	0 %	25 %	50 %	25 %	126432630
515	NC_009077	CTG	2	6	19258	19263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432630
516	NC_009077	CTG	2	6	19267	19272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432630
517	NC_009077	ATCAG	2	10	19286	19295	40 %	20 %	20 %	20 %	126432630
518	NC_009077	GTG	2	6	19352	19357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126432630
519	NC_009077	GCGG	2	8	19559	19566	0 %	0 %	75 %	25 %	126432630
520	NC_009077	TTC	2	6	19595	19600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126432630
521	NC_009077	CGA	2	6	19632	19637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432630
522	NC_009077	GCGGT	2	10	19674	19683	0 %	20 %	60 %	20 %	126432630
523	NC_009077	GCC	3	9	19687	19695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432630
524	NC_009077	GCC	2	6	19705	19710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432630
525	NC_009077	GCG	3	9	19799	19807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432630
526	NC_009077	GTG	2	6	19808	19813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126432630
527	NC_009077	CGGG	2	8	19833	19840	0 %	0 %	75 %	25 %	126432630
528	NC_009077	CG	3	6	19855	19860	0 %	0 %	50 %	50 %	126432630
529	NC_009077	CTG	2	6	19894	19899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432630
530	NC_009077	CGC	2	6	19903	19908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432630
531	NC_009077	CGT	2	6	19923	19928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432630
532	NC_009077	CAG	2	6	19936	19941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432630
533	NC_009077	GGC	2	6	20056	20061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432630
534	NC_009077	CTG	2	6	20062	20067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432630
535	NC_009077	TGG	2	6	20082	20087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126432630
536	NC_009077	GCC	2	6	20098	20103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432630
537	NC_009077	GAA	2	6	20122	20127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126432630
538	NC_009077	CGG	2	6	20138	20143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432630
539	NC_009077	TCG	2	6	20156	20161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432630
540	NC_009077	GGAACC	2	12	20271	20282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432630
541	NC_009077	CAG	2	6	20308	20313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432630
542	NC_009077	CCG	2	6	20318	20323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432630
543	NC_009077	TCG	2	6	20354	20359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432630
544	NC_009077	GGC	3	9	20517	20525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432631
545	NC_009077	GCA	2	6	20585	20590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432631
546	NC_009077	CAG	2	6	20601	20606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432631
547	NC_009077	CAG	2	6	20616	20621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432631
548	NC_009077	CCG	2	6	20629	20634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432631
549	NC_009077	GGT	2	6	20649	20654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126432631
550	NC_009077	CCG	2	6	20686	20691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432631
551	NC_009077	ACG	2	6	20692	20697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432631
552	NC_009077	AAC	2	6	20701	20706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126432631
553	NC_009077	CGG	2	6	20732	20737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432631
554	NC_009077	CACG	2	8	20759	20766	25 %	0 %	25 %	50 %	126432631
555	NC_009077	CTC	2	6	20844	20849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126432631
556	NC_009077	GCG	2	6	20857	20862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432631
557	NC_009077	ATG	2	6	20863	20868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126432631
558	NC_009077	CGC	2	6	20880	20885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432631
559	NC_009077	GCC	2	6	20931	20936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432631
560	NC_009077	CCAG	2	8	21002	21009	25 %	0 %	25 %	50 %	126432631
561	NC_009077	GCACCC	2	12	21014	21025	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	126432631
562	NC_009077	CGC	2	6	21063	21068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432631
563	NC_009077	ACG	2	6	21134	21139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432631
564	NC_009077	CAG	3	9	21144	21152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432631
565	NC_009077	ATC	2	6	21178	21183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126432631
566	NC_009077	CGC	2	6	21204	21209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432631
567	NC_009077	CAG	2	6	21210	21215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432631
568	NC_009077	CG	3	6	21227	21232	0 %	0 %	50 %	50 %	126432631
569	NC_009077	ATCC	2	8	21243	21250	25 %	25 %	0 %	50 %	126432631
570	NC_009077	CGA	2	6	21293	21298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432631
571	NC_009077	CGG	2	6	21302	21307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432631
572	NC_009077	GAA	2	6	21309	21314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126432631
573	NC_009077	CAG	3	9	21318	21326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432631
574	NC_009077	GCA	2	6	21413	21418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432631
575	NC_009077	CTG	2	6	21549	21554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432631
576	NC_009077	GCC	2	6	21564	21569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432631
577	NC_009077	CCCG	2	8	21575	21582	0 %	0 %	25 %	75 %	126432631
578	NC_009077	ATC	2	6	21616	21621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126432631
579	NC_009077	ACC	2	6	21649	21654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126432631
580	NC_009077	GAG	2	6	21657	21662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126432631
581	NC_009077	GCG	2	6	21687	21692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432631
582	NC_009077	CGG	2	6	21731	21736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432631
583	NC_009077	CCA	2	6	21782	21787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126432631
584	NC_009077	CAG	2	6	21789	21794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432631
585	NC_009077	GGT	2	6	21801	21806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126432631
586	NC_009077	CAG	2	6	21825	21830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432631
587	NC_009077	GCG	2	6	21860	21865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432631
588	NC_009077	GGT	2	6	21894	21899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126432631
589	NC_009077	CGC	2	6	21905	21910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432632
590	NC_009077	TGG	2	6	21932	21937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126432632
591	NC_009077	GCG	2	6	21979	21984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432632
592	NC_009077	CGT	2	6	21992	21997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432632
593	NC_009077	TCG	2	6	22042	22047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432632
594	NC_009077	GCG	2	6	22069	22074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432632
595	NC_009077	GCG	2	6	22078	22083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432632
596	NC_009077	GTC	2	6	22098	22103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432632
597	NC_009077	GGGC	2	8	22109	22116	0 %	0 %	75 %	25 %	126432632
598	NC_009077	TCG	2	6	22167	22172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432632
599	NC_009077	CCG	2	6	22179	22184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432632
600	NC_009077	ACC	2	6	22197	22202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126432632
601	NC_009077	GAG	2	6	22238	22243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126432632
602	NC_009077	GTA	2	6	22403	22408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126432632
603	NC_009077	GTT	2	6	22409	22414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126432632
604	NC_009077	CAC	2	6	22451	22456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126432632
605	NC_009077	CAC	2	6	22460	22465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126432632
606	NC_009077	GAT	2	6	22478	22483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126432632
607	NC_009077	GCG	2	6	22487	22492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432632
608	NC_009077	CTT	2	6	22505	22510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126432632
609	NC_009077	GCGTT	2	10	22548	22557	0 %	40 %	40 %	20 %	126432632
610	NC_009077	CG	3	6	22574	22579	0 %	0 %	50 %	50 %	126432632
611	NC_009077	CGG	2	6	22582	22587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432632
612	NC_009077	TCG	3	9	22608	22616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432632
613	NC_009077	CGTAGT	2	12	22654	22665	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126432632
614	NC_009077	CCA	2	6	22666	22671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126432632
615	NC_009077	CGA	2	6	22678	22683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432632
616	NC_009077	GCC	2	6	22703	22708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126432632
617	NC_009077	CAG	2	6	22820	22825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126432632
618	NC_009077	GC	4	8	22888	22895	0 %	0 %	50 %	50 %	126432632
619	NC_009077	CCT	2	6	22927	22932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126432632
620	NC_009077	CGG	2	6	22933	22938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432632
621	NC_009077	TCG	2	6	22950	22955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432632
622	NC_009077	GTC	2	6	22976	22981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432632
623	NC_009077	GTG	2	6	23085	23090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126432632
624	NC_009077	GCG	2	6	23127	23132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126432632
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626	NC_009077	TCG	4	12	23193	23204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126432632
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